劳动合同双方协商解除的流程如下：
1.协商达成一致：在自愿、平等协商的基础上，双方应当达成一致意见。这包括解除的原因、方式、时间、解除后的处理等具体内容。
2.通知工会：如果用人单位有工会，应当在解除劳动合同前通知工会，并听取工会的意见。如果工会提出异议，需要研究工会的意见后作出决定，并将处理结果通知工会。
3.办理工作交接：用人单位应当安排员工依照相关规定办理工作交接，包括交接工作、资料等事项。
4.结算薪资和经济补偿：在员工办理完毕工作交接后，用人单位应当结算并支付该员工的薪资。如果是用人单位提出解除合同，还应当结算并支付该员工的经济补偿。
5.劳动合同解除：完成上述流程后，劳动合同按双方约定解除。双方应当在解除劳动合同后继续保持良好的合作关系，避免引发不必要的纠纷和矛盾。
6.出具离职证明：在解除劳动合同时，用人单位应当出具解除劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。
7.备案：对解除的劳动合同的文本原稿及原电子档案进行备案，至少保存二年备查。